El CIDI ha establecido comisiones interamericanas relacionadas con las áreas prioritarias del Plan Estratégico.
El CIDI ha definido en cada caso la naturaleza, finalidad, estructura y funcionamiento de las comisiones establecidas y funcionan con sus propios reglamentos.
Las comisiones interamericanas tienen por finalidad dar continuidad al diálogo sectorial de cooperación solidaria en un determinado sector, hacer el seguimiento de los mandatos decididos a nivel ministerial e identificar iniciativas multilaterales de cooperación y estarán integradas por las autoridades sectoriales político-técnicas acreditadas por el gobierno de cada Estado Miembro.

Las siguientes son las comisiones interamericanas del CIDI: